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DNA编码化合物库(DEL,DNA-Encoded Library)利用具有特定序列的DNA标签对所有参与构筑的分子砌块与骨架进行编码,通过“拆分-合并”的组合方式,可快速产生数以百万甚至亿计可识别的化合物分子。DEL技术平台为药物分子的发现与创造提供海量的分子库,凭借显著的成本、速度和规模优势,为医药行业赋能。
成都先导DEL技术平台目前涵盖的分子类型主要包括传统小分子、多肽类分子、大环类分子、共价类分子、片段类分子、蛋白降解类分子(PROTAC,Molecular Glue)等;同时,进一步增加糖类分子在DEL分子中的多样性,亦是成都先导DEL团队的研发方向之一。(校企联合,成都先导携手四川大学共促DEL技术持续发展)
近日,上海交通大学变革性分子前沿科学中心朱峰课题组与成都先导药物开发股份有限公司(简称“成都先导”),合作开发了与DNA兼容的基于糖的交叉偶联反应,为糖类分子在DEL产品中的拓展提供了新的方案,同时带来了全新的DNA编码化合物库分子结构类型与化学空间。目前,该成果发表在Nature Communications,题为“Palladium-catalyzed Suzuki-Miyaura cross-couplings of stable glycal boronates for robust synthesis of C-1 glycals”(图1)。
图1:所属方法的科研论文
该方法设计开发了具有良好的反应活性、稳定性、易于纯化处理的新型的糖基硼酸酯(R-B(pai), R-B(Epin)),有效地克服了基于糖基结构的Suzuki–Miyaura偶联反应中的稳定性问题。并利用创新糖基硼酸酯的反应性和稳定性,建立了一种稳健的钯催化糖基Suzuki–Miyaura反应,促进了在温和条件下各种基于糖类底物的多类型C-C键的构筑。该方法具有良好的反应活性、稳定性、通用性,并且易于处理,底物耐受广泛,在制备c-糖基化合物和天然产物方面具有广泛的应用前景。(图2)
图2:该方法的主要优势
该方法除了在传统小分子合成应用中取得突破外,研发团队也成功利用该体系,实现糖基底物在DNA偶联物上的拓展,以丰富的DNA-芳基卤底物与多种类型的糖基硼酸酯进行交叉测试,得到了优良的反应结果。将糖基结构引入到DEL分子中,为基于糖类结构的药物发现和化学生物学研究提供了重要的前景。(图3)
该方法的实现,将带来数以百万计甚至数以亿计的DNA偶联卤化物中间体与多类型糖基分子的组合,将极大程度地丰富糖基DEL分子的构筑。
图3:基于DNA偶联物的底物普适性展示
同时,研究团队利用该方法得到的C1取代糖烯化合物,进一步进行分子改造,以非常经济、高效、温和的方式实现多种具有潜在生物活性的糖基药物分子合成。同时也为糖基DEL分子的演化与发展提供了重要的方向指引。(图4)
图4:糖烯底物普适性展示
成都先导DEL技术团队在十余年的DEL设计、开发、生产、筛选过程中配资行情网,积累了大量的DEL研发经验与分子创造经验,不仅致力于为具有药物发现需求的客户提供不断更新的万亿级DEL分子以及药物分子发现方案,还持续致力于与高校、研究机构开展合作,赋能前沿科学研究与探索。
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